Префектура в Москве — это территориальный орган Правительства Москвы, который осуществляет управление на местах. Префектуры контролируют районные учреждения, распределяют бюджетные деньги, составляют отчётность, участвуют в вопросах землепользования, охраны окружающей среды, градостроительства и контролируют деятельность индивидуальных предпринимателей.
Вышестоящее учреждение - Правительство Москвы (Мэрия), подведомственные учреждения - управы районов.